胸腺嘧啶DNA糖基化酶在多能細(xì)胞中調(diào)控細(xì)胞周期驅(qū)動的p53轉(zhuǎn)錄控制
在哺乳動物發(fā)育進(jìn)程中,多能干細(xì)胞起源于著床前囊胚的內(nèi)細(xì)胞團(tuán)(ICM),并形成外胚層。
多能干細(xì)胞研究,離不開干細(xì)胞培養(yǎng)體系的建立,Ausbian干細(xì)胞專用培養(yǎng)基,是在含微量胎牛血清的基礎(chǔ)培養(yǎng)基中,通過添加一種人永生化干細(xì)胞系的條件培養(yǎng)基混合組成,是一款即用型干細(xì)胞培養(yǎng)基。
Ausbian干細(xì)胞培養(yǎng)基此款培養(yǎng)基含有多種促進(jìn)細(xì)胞增殖的生長因子,如:表皮生長因子(EGF)、成纖維細(xì)胞生長因子(FGF)、神經(jīng)細(xì)胞生長因子(NGF)、肝細(xì)胞生長因子(HGF)、腦源性神經(jīng)營養(yǎng)因子(BDNF)、血小板衍生生長因子(PDGF)、血管內(nèi)皮生長因子(VEGF)、轉(zhuǎn)化生長因子(TGF)及干細(xì)胞分化抑制因子等。
研究表明,來自小鼠囊胚ICM的小鼠胚胎干細(xì)胞(mESC)保留了生成胚胎組織的潛能。當(dāng)在含有白血病抑制因子(LIF)和兩種靶向MEK/ERK和GSK3的選擇性激酶抑制劑的無血清培養(yǎng)基(即2iLIF培養(yǎng)基)中培養(yǎng)時,mESC還表現(xiàn)出一些轉(zhuǎn)錄組學(xué)和表觀基因組學(xué)特征。特別是mESC在ICM中的細(xì)胞周期特征,如G1期的縮短和復(fù)制時間的減少,在這種培養(yǎng)條件下得以保留。
有趣的是,多能mESC對外源信號的響應(yīng)能力存在差異,這種反應(yīng)多樣性的主要驅(qū)動因素被認(rèn)為涉及轉(zhuǎn)錄和/或轉(zhuǎn)錄后異質(zhì)性。此外,細(xì)胞周期不僅在調(diào)節(jié)生物體中細(xì)胞數(shù)量方面發(fā)揮著典型功能,還被認(rèn)為是一種在時間上分離多種細(xì)胞命運選擇的機(jī)制。細(xì)胞周期的進(jìn)行與細(xì)胞對分化刺激反應(yīng)的變化密切相關(guān)。
然而,目前在多能性的初始基態(tài)下,控制細(xì)胞周期相關(guān)分子和功能多樣性的內(nèi)在決定因素仍然大多數(shù)未知。進(jìn)一步的研究將有助于揭示這些多能性細(xì)胞的神秘之處,并為生物醫(yī)學(xué)和再生醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用提供更深入的了解。
細(xì)胞周期進(jìn)展與轉(zhuǎn)錄組動力學(xué)和多能細(xì)胞對分化線索的反應(yīng)變化有關(guān),主要是通過未知的決定因素。
近日,研究人員對小鼠胚胎干細(xì)胞(mESCs)在初始基態(tài)下的細(xì)胞周期相關(guān)轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組進(jìn)行了表征。研究人員發(fā)現(xiàn)胸腺嘧啶DNA糖基化酶(TDG)是腫瘤抑制因子p53的細(xì)胞周期調(diào)節(jié)輔助因子。
此外,TDG和p53共同結(jié)合esc特異性順式調(diào)控元件,從而在自我更新過程中控制p53依賴基因的轉(zhuǎn)錄。科研人員確定TDG的動態(tài)表達(dá)是促進(jìn)細(xì)胞周期相關(guān)轉(zhuǎn)錄異質(zhì)性所需要的。
此外,該項研究證明了TDG的短暫耗盡會影響mESCs早期分化過程中的細(xì)胞命運決定。研究結(jié)果揭示了TDG在細(xì)胞周期中促進(jìn)分子異質(zhì)性的意想不到的作用,并強(qiáng)調(diào)了蛋白質(zhì)動力學(xué)在發(fā)育過程中對細(xì)胞命運的時間控制中的核心作用。
總結(jié):
多能細(xì)胞周期的時間蛋白質(zhì)組學(xué)
TDG控制多能細(xì)胞中細(xì)胞周期驅(qū)動的轉(zhuǎn)錄異質(zhì)性
在多能細(xì)胞中,TDG和p53相互作用并共同結(jié)合基因調(diào)控元件
TDG在分化過程中控制細(xì)胞周期相關(guān)的細(xì)胞命運決定